مرحوم خاتم یزدی، در اولین سال حضور در قم با ایشان( سید مصطفی خمینی) آشنا شدند و در قم و نجف همواره رفیق شفیق او بودند.

ایشان درباره ویژگی های علمی و اخلاقی مرحوم مصطفی خمینی می گوید: مرحوم حاج آقا مصطفی ضمن تقید به احكام شرعی با تحمل ریاضت در صدد تعالی روح و اصلاح بیش از پیش نفس بود و در این راستا غالب اوقات، به ویژه در ایام زیارتی حضرت اباعبدالله الحسین علیه السلام مثل اول ماه رجب و نیمه همین ماه و اول و نیمه ماه شعبان و روز عاشورا و اربعین حسینی با پای پیاده از نجف به كربلا مشرف می شد»

منبع: hawzah.net