دانشنامه مهدی موعود (عج) با طبقه‌بندی ۲۰۵۳ مطلب شامل مقاله، گزیده کتاب، پرسش و پاسخ و چکیده پایان نامه و تحت ۱۰۴ نمایه، شامل ۲۷ نمایه اصلی و ۷۷ نمایه فرعی، با هدف جمع‌آوری مطالب مختلف درباره ابعاد وجودی امام عصر(عج)، در اختیار علاقه‌مندان و کاربران فضای مجازی قرار دارد.
«موعود و منجی‌گرایی در ادیان و مکاتب»، «دکترین مهدویت و مبانی کلامی آن»، «زندگی‌نامه امام(عج)»، «شباهت‌های امام زمان(عج) با انبیاء و چهارده معصوم(ع)» و «عصر غیبت صغری و غیبت کبرا»، از نمایه‌های اصلی این دانشنامه است.
«حاکمیت دینی و ولایت فقیه در زمان غیبت»، «آسیب‌شناسی مهدویت»، «صفات و ویژگی‌های یاران منتظر و آداب انتظار»، «علائم ظهور»، «مهدویت و جهان غرب»، «وضعیت جهان در زمان ظهور و پس از آن»، «آخرالزمان»، «شبهه‌شناسی مهدوی» و «جعت در قرآن»، از دیگر نمایه‌های اصلی دانشنامه امام مهدی(عج) است.
علل و عوامل غیبت امام(عج) و تشرفات و ملاقات بزرگان و عنایات امام(عج) به دیگران، مکان و زمان ظهور و قیام امام(عج)، ایرانیان و نقش آنان در قیام و عصر ظهور، نقش جوانان و بانوان در زمان ظهور، اهل کتاب در دولت امام (عج) و همچنین سیره حکومتی و ویژگی‌های حکومت امام زمان(عج) از جمله نمایه‌های فرعی این دانشنامه است.
نمایه های دانشنامه شامل:
- موعود و منجی گرائی در ادیان و مكاتب ۱۱۸
- دكترین مهدویت و مبانی كلامی مهدویت ۲۰
- امام زمان مهدی موعود علیه السلام در آئینه قران و حدیث ۱۳۴
- زندگی نامه امام زمان مهدی موعود علیه السلام ۱۴۸
- شباهت های امام زمان مهدی موعود علیه السلام با انبیاء و چهارده معصوم ۲۴
- امام زمان مهدی موعود علیه السلام و امام حسین علیه السلام ۲۶
- عصر غیبت صغرا و غیبت كبرا امام زمان علیه السلام ۴۳۳
- حاكمیت دینی و ولایت فقیه در زمان غیبت امام زمان علیه السلام ۸
- آسیب شناسی مهدویت ۱۰۰
- صفات، ویژگی ها و آداب منتظران ظهور امام زمان علیه السلام ۳۵۳
- علائم ظهور امام زمان مهدی موعود علیه السلام ۵۳
- دكترین مهدویت و حكومت جهانی مهدوی ۲۵
- مهدویت و جهان غرب ۷۴
- وضعیت جهان در آستانه ظهور و پس از ظهور ۱۸
- عصر ظهور امام زمان علیه السلام ۲۲۷
- رجعت در قران و روایات و آراء دانشمندان شیعه و اهل سنت ۴۴
- آخرالزمان ۲۰
- شبهه شناسی مهدویت ۳۷
- حضرت مهدی علیه السلام، پرسش و پاسخ ۲۶۰
- اماكن منتسب به امام زمان مهدی موعود علیه السلام ۶۹
- امام زمان مهدی موعود علیه السلام در ادعیه و زیارات ۷۵
- امام زمان علیه السلام از دیدگاه دیگران ۳۵
- علماء و اندیشمندان مسلمان و غیر مسلمان ۹۸
- حضرت مهدی علیه السلام در ادبیات، شعر و هنر ۴۹۲
- حضرت مهدی علیه السلام، كتاب و كتاب شناسی (پایان نامه و مقاله) ۱۵۰
- حضرت مهدی (عج) رسانه و اینترنت ۵۹
- ویژه نامه و مناسبت های حضرت مهدی علیه السلام ۱
- امام مهدی(عج) از نگاه امامان (علیهم السلام) ۶
- امام مهدی (عج)، مهدویت، حكومت و سرنوشت ادیان ۶